Estimado vecino,
No existe ningún método específico para este caso. Existen productos para eliminar la silicona aunque desconozco si existe alguno aplicable a la madera y el uso de disolventes o acetona puede dañarla o mancharla, más si está barnizada.
Me temo que tendrás que recurrir a soluciones "caseras", si raspando, siempre con un material que no raye la madera (por ejemplo un raspador de plástico), no es suficiente, una idea a título personal sería la de cortar o rascar los pegotes dejando una lámina en la base para no rayar la madera y a lo que quede aplicarle una fuente de calor (por ejemplo la plancha), sobre un trapo o papel de cocina para fundir la silicona y absorberla, aunque como te comento es una idea.
Hagas lo que hagas, prueba siempre en alguna zona poco visible para ver el resultado antes.
Suerte,