Buenas noches abgarcia.
El impuesto de actos juridicos documentados, si se paga dos veces. Lo debes pagar por el importe de la compraventa y luego por el importe de la hipoteca. Este impuesto se paga independientemente de donde cojas la hipoteca.
Te dejo el siguiente link donde te puedes hacer una idea de los gastos que puedes tener
http://www.cajamadrid.es/CajaMadrid/Home/cruce/0,0,3813,00.html Los bancos y cajas, aqui me incluyo, jugamos con los otros gastos para poder captar clientes
Espero haberte aclarado algo
Saludos