Hola Carmeno,
Cada caso hay que estudiarlo aparte, deberías echar unos números y ver qué hipoteca te sale más rentable.
Tanto si te subrogas como no, deberías informar por escrito a la promotora y al Santander, para que hagan los trámites oportunos.
Los gastos que tendrías al crear una hipoteca nueva dependerán del crédito que pidas, pero debes considerar los gastos de tasación, Actos Jurídicos Documentados (AJD), notaría y registro, comisión de apertura... Con el Santander te ahorras todos estos gastos, pero tendrás un gasto por la subrogación. Al fin y al cabo es cuestión de echar cuentas, considerando el tipo de interés, comisiones de cancelación parciales, y demás condiciones y ver qué te sale más rentable.
Casi todos los bancos tienen en sus páginas web un simulador hipotecario que te puede servir para ver estos gastos.
Espero haberte ayudado. Saludos