Supongo que tenías entonces 28.000 y pico en tu cta. vivienda.
Si es así, y has pagado 27.000 en el contrato, tienes dos opciones, o gastar los otros mil y pico en las primeras letras, o bien devolver el 15% y desgravártelo de esas primeras letras. En cualquier caso te da igual, ya que ambas desgravaciones son del 15%.
Por lo de los 4 años, no te preocupes, ya que cuentan hasta el primer pago, y ya lo has hecho, por lo que puedes mantener ahí el dinero y seguir desgravándote de las nuevas aportaciones, pero siempre ten en cuenta esta máxima: el mismo dinero no puede desgravar dos veces.