Hola,
El que dos propiedades estén dentro de la misma escritura no significa que se tengan que vender juntas, por ejemplo, la primera plaza de garaje que viene ligada con la vivienda tendrá (seguramente) una mención especial en la escritura en sí y constará que son indivisibles, pero la segunda plaza de garaje puede estar en la misma escritura o en otra y constar como una propiedad independiente del piso y de la primera plaza... Vamos que si están escrituradas como propiedades diferentes da igual que estén en el mismo papel.