Hola pedrosanz85, depende de tus necesidades, de tu perfil y de lo que cobres.
Yo preferiría amortizarlo si no tienes interéses en adelantar el dinero, ya que algunas hipotecas por adelantar dinero te cobran comisión, tienes que mirar eso.
Adelantando/amoritzando la hipoteca te capitzalizas, y tambien es una forma de ahorro ya que puedes rebajar cuota o años.
Si se tiene dinero, siempre hay que pagar lo que se debe primero.
Saludos