Hola Viatore,
Lo primero que haría sería hablar con algún técnico de Urbanismo del Ayuntamiento de Ciempozuelos para que os explicaran cuáles son los requisitos que, según el Plan General y otras normativas, debe tener un local comercial para poder ser habilitado como tal.
Lo digo porque lo normal es que te exijan que tenga acometidas particulares de servicios básicos (agua, saneamiento, electricidad y telecomunicaciones), unos mínimos de ventilación e iluminación natural, ventilación mecánica (extracción), superficies mínimas... Todo esto os puede condicionar desde el primer momento vuestra intención de alquilar estas salas como locales si cumplen con todos los requisitos, valorando las obras necesarias para cumplirlos, o si sólo podéis considerarlas como trasteros.
El Libro del Edificio, aunque no sé si os puede ayudar demasiado, lo podéis encontrar en el archivo municipal, o, si todavía existe y hay buenas relaciones, en la promotora.
Respecto a las obligaciones fiscales, en caso de ser locales comerciales entiendo que tendríais que hacer declaración del IVA y renta, como cualquier autónomo o sociedad.
Al ser la Comunidad la Propietaria de los locales, entiendo que en las cláusulas de los contratos se pueden establecer todo tipo de restricciones y condiciones de uso, siempre que respeten la legalidad. Limitar el tipo de actividad es tan fácil como no arrendarlo a aquellas personas que tengan intención de realizar actividades que no os gusten.