El problema de los autonomos siempre es el nivel de ingresos, ya que normalmente trabajan con dinero en B. La ventaja que teneis es que no declarais lo que ganais, pero luego a la larga, al pedir prestamos, los bancos os cobran mas... logicamente.
Sinceramente, con el nivel de ingresos que declarais los dos, estais mas o menos en un 45% de endeudamiento.
Creo que lo mejor es, como dice cardenas, que pidais la hipoteca en los bancos con los que trabaja la empresa, ya que en el resto de bancos lo tendreis muy complicado.